概念不清，把生物安全与综合防治混为一谈。实质上，生物安全措施更强调生产系统中各部分间的联系和对生物安全的影响。生物安全是一个系统工程，综合了兽医微生物学、环境学、建筑学、设备工艺、生态学和微生态学、营养学等多门学科和系统工程，涉及生产过程的每一个环节，忽视任何一个环节都可能造成整个系统的失败。生物安全更强调病原的控制和传播，通过生物安全有效控制传播途径，减少和去除致病因子。生物安全的全过程都是围绕五黑鸡苗预防传染源进人养殖场和控制病原在养殖场内传播展开的对生物安全的全部内涵认识不清，尤其不能很好地结合当地情况的不同生产类型，组建有特色生物安全体系。

        生产模式制约，目前我国是大中小绿壳蛋鸡苗养殖企业或养殖专业户并存，中小企业或养殖专业户占绝大比例。他们资金紧缺场地面积小，选择、规划和布局不合理，圈舍简陋，防疫设施缺乏，管理水平低，加之专业知识匾乏，防疫意识差直接制约生物安全的推行。其生物安全多以一个单位为执行范围，缺少大范围、全系统的生物安全协调作用，其作用发挥受到限制。