生产中引起五黑鸡苗发病和死亡的原因很多，但主要还是由于发生传染病和管理不善造成的。不少养鸡场采用的仍是非标准化养殖模式。随着养鸡生产经营主体多元化，一些养鸡场为扩大生产盲目引种，由于检测手段不健全、防疫队伍不稳定，致使疫病防治出现疏漏，鸡场不时受到外来病原的侵袭而暴发俊病。长期大范围盲目滥用抗菌药物，人为造成了养殖场中一些常见细菌产生广而强的耐药性，导致鸡群发病后治疗效果不佳。自然野毒株在免疫鸡群中长期存在，一旦鸡群中某些个体抵抗力低下或遇到应激时，就可引起传染病的发生和流行从业人员缺乏相关专业知识，集约化饲养管理经验不足，对控制疫病的认识不够对鸡病未能做到以防为主。

       加上片面追求一时的经济效益，使用低劣饲料、兽药、疫苗不能严格执行卫生防疫制度等，导致疫病难以控制。由于五黑绿壳蛋鸡苗的迅猛发展，以及鸡群流动频繁、防疫卫生技术跟不上等原因，鸡病在各鸡场不断发生和流行。据有关资料不完全统计，对我国养鸡业构成威胁和造成危害的疫病已达80多种，涉及传染病、营养代谢病和中毒性疾病。鸡病中以传染病为最多，约占鸡病总数的75%以上，且防治难度增大。