保持环境清洁卫生和消毒是五黑鸡苗养殖的安全措施的一个方面，如进行彻底打扫可减少约90%的病毒含量;如喷洒常规消毒剂可降低95%以上病毒;如进行甲醛和高锰酸钾熏蒸，病毒和细菌的杀灭率可达99.9%;如同时使用，则可基本杀灭环境中的病原。而免疫接种和药物防治只能针对某些疫病，所以生物安全、免疫接种和药物防治的范围有较大不同。但是，生物安全与免疫接种、药物防治是相辅相成的，现代化饲养管理体系下的疫病控制中，生物安全已经同免疫接种、药物防治共同组成了疫病控制体系。良好的生物安全措施可以为免疫接种和药物防治提供一个良好的使用环境，提高免疫接种和药物防治效果。

       如传染性法氏囊病毒(IBDV )、马立克病毒(MDV)、传染性贫血病毒(CIAV )、网状内皮增生症病毒(REV)和J亚群白血病病毒(ALV一J)等感染五黑绿壳蛋鸡苗后，不仅会发病，而且发生免疫抑制二，影响体液免疫、细胞免疫和巨噬细胞吞噬三大免疫功能，对多种疫苗免疫应答下降，造成免疫效果差，甚至免疫失败;种鸡场净化不好，经蛋传播病原可垂直传播，而呈放大现象或鸡场多种病原污染，混合感染和继发感染或病原间存在协同作用，从而导致病因复杂、病情严重、诊断困难，使疫病控制更加困难。