碘的杀菌力比氯强，不但能杀灭细菌、原虫，而且能杀灭真菌。在绿壳蛋鸡苗鸡群中有嗉囊真菌病时，常使用碘消毒剂。连续使用时，饮水中碘的浓度为12毫克／升；定期使用时，饮水中碘的浓度为25毫克／升。碘用于饮水消毒可按1升水加入2%碘酊5～6滴，能杀死病原菌及原虫等。季铵化合物用于饮水消毒适用于14周龄以下的鸡，产蛋鸡不能使用。目前，很多鸡场使用乳头式饮水器，这是控制鸡舍中饮水污染的极好办法。

      绿壳蛋鸡苗鸡场的环境卫生，鸡场的环境卫生包括鸡群生存的小环境（鸡舍）卫生和大环境（生产区）卫生两方面。实践证明，在环境卫生好的鸡场，鸡群健康，很少发生疫病，一旦发生疫病也容易控制。在环境卫生差的鸡场，疫病频频发生，难于消灭。因此，鸡场环境的好坏，关系到养鸡的成败和鸡场的经济效益。鸡舍卫生，鸡舍中病原微生物的来源及其危害  鸡舍是鸡群生活的小环境，在密集饲养的鸡舍中，鸡咳嗽、打喷嚏、呜叫和采食均可喷出小液滴。